令人感到十分諷刺的是，假面騎士滅亡迅雷再次成為了人類的敵人。  哉亞日本公司發(fā)生了大規(guī)模爆炸事件，而罪魁禍?zhǔn)拙谷皇菧缤鲅咐渍荆棵鎸π侣劙l(fā)布會上記者的質(zhì)問，刃唯阿表示暫不做任何回應(yīng)。上級也在不斷施壓，假面騎士巴爾坎（不破諫）與假面騎士瓦爾基里（刃唯阿）不得不做出抉擇。  理解人類和修碼吉亞兩方立場的不破諫與刃唯阿，都有各自的堅持，是為了守護(hù)所有生命而戰(zhàn)？還是為了自己的規(guī)則而戰(zhàn)？ 他們與假面騎士滅亡迅雷之間的戰(zhàn)斗究竟結(jié)果如何——！？